Lekárska genetika a diagnostika 2/2025
Nová delece klastru genu ATAD3 jako příčina pontocerebelární hypoplazie, hypotonie a syndromu respirační insuficience u novorozence
Mgr. Renáta Michalovská, Ph.D., Mgr. Helena Paszeková, MUDr. Zděnka Vlčková, MUDr. Václava Curtisová, MSc., MUDr. Ivana Marková, Ph.D., MUDr. Martin Schwarz, Ph.D., MBA
Neonatální letální pontocerebelární hypoplazie, hypotonie a respirační insuficience (PHRINL) je autozomálně recesivní multisystémové onemocnění s prenatálním nástupem a úmrtím v novorozeneckém období. U novorozence mužského pohlaví, který zemřel krátce po porodu, jsme detekovali homozygotní deleci zasahující geny ATAD3B a ATAD3A. Byla provedena analýza klinického exomu pomocí masivně paralelního sekvenování u vzorku DNA z periferní krve probanda, matky, otce a plodové vody z nového probíhajícího těhotenství matky. Byly detekovány delece v genovém klastru ATAD3. Otec byl heterozygotní nosič delece zahrnující exony 4-16 genu ATAD3B a exony 1-4 genu ATAD3A a matka byla nosičkou heterozygotní delece zahrnující exony 10-12 genu ATAD3C, celý gen ATAD3B (exony 1-16) a exony 1-2 genu ATAD3A. Plod z aktuální gravidity zdědil pouze maternální variantu. V rodině jsme identifikovali nové, dosud nepopsané delece v genovém klastru ATAD3, které byly přítomny u obou rodičů a jejichž překrývání bylo příčinou homozygotní delece u prvního zemřelého potomka.
Kľúčové slová: klastr genu ATAD3, pontocerebelární hypoplazie, neonatální respirační insuficience, klinický exom, NGS
A novel deletion in the ATAD3 gene cluster as a cause of pontocerebellar hypoplasia, hypotonia, and respiratory insufficiency syndrome in a newborn
Neonatal lethal pontocerebellar hypoplasia, hypotonia, and respiratory insufficiency (PHRINL) is an autosomal recessive multisystem disorder with prenatal onset and death occurring in the neonatal period. In a male newborn who died shortly after birth, we detected a homozygous deletion affecting the ATAD3B and ATAD3A genes. Clinical exome analysis was performed using massively parallel sequencing of DNA from the proband’s peripheral blood, the mother, the father, and amniotic fluid from the mother’s ongoing pregnancy. Deletions were identified within the ATAD3 gene cluster. The father was a heterozygous carrier of a deletion spanning exons 4–16 of ATAD3B and exons 1–4 of ATAD3A, while the mother was a heterozygous carrier of a deletion involving exons 10–12 of ATAD3C, the entire ATAD3B gene (exons 1–16), and exons 1–2 of ATAD3A. The fetus from the current pregnancy inherited only the maternal variant. We identified novel, previously unreported deletions in the ATAD3 gene cluster in this family, present in both parents, whose overlap was the cause of the homozygous deletion in the first deceased child.
Keywords: ATAD3 gene cluster, pontocerebellar hypoplasia, neonatal respiratory insufficiency, clinical exome sequencing, NGS
